ヽ三・ｗ・三ノ Base64エンコーディングをするときは・・・

3バイト区切りで！
3バイト区切りで！

バイナリを読むときに3バイト区切りで読み込まないと、
途中に"="が入ってるダメな感じの子にナッチャウヨー

StreamWriter writer = new StreamWriter(filePath);

using (datFile)
using (writer)
{
  BinaryReader reader = new BinaryReader(datFile);

  // 3の倍数で分割すると途中でパディングされない
  // 36KBで分割
  byte[] buffer = new byte[36864];

  long remain = datFile.Length;
  int readBytes = 0;

  while (0 < remain)
  {
    readBytes = reader.Read(buffer, 0, (int)Math.Min(buffer.Length, remain));
    String contentString = Convert.ToBase64String(buffer, 0, readBytes);
    contentStringLength += contentString.Length;

    writer.Write(contentString);

    remain -= readBytes;
  }
  reader.Close();
}